Tout dépend de l'espèce dont tu parles.
Souris : cannibalisme fréquent donc précautions à prendre.
Rat et mastomys : pas de nécessité de séparer les femelles gravides.
En revanche tu peux tout à fait ballader ton mâle reproducteur de cage en cage pour ne pas trop fatiguer tes femelles.
Dans tous les cas, mieux vaut faire coïncider un changement de litière avec l'ajout d'un individu dans un groupe afin d'éviter les bastons.
Si la litère est neuve, les membres du groupe ne ressentiront pas l'arrivée du nouveau comme un intrusion et lui feront meilleur accueil.